Несмотря на то что Иркутск, бывший до 1686 года острогом, был основан в 1661 году и здесь бывали служилые татары и бухарские купцы, мусульманская община возникла сильно позже. Активное переселение крестьян — татар из Поволжья в Иркутскую губернию началось во второй половине XIX века.
Первые мусульманские общины образовались не в центре губернии, а в Иркутском уезде. В деревнях уезда строили мечети — деревянные одноэтажные дома с площадкой для муэдзина. Постепенно мусульмане расселялись по губернии: всего к 1917 году в ней работало 23 мечети.
В самом Иркутске татарская мусульманская община сложилась к 1860 году, но мечети в городе долго не было: по праздникам ездили молиться в село Пивовариха — так стала называться деревня Николоямская. Мечеть построили после многих лет отказов властей только в 1897 году.
В 1905 году был утвержден устав Иркутского мусульманского благотворительного общества. Это первый известный документ магометанской общины, составленный на русском языке, отпечатанный типографским методом.
Появление общества связано с движением джадидов — мусульман-прогрессистов. Общество занималось поддержкой бедных членов общины, следило за содержанием мусульманских кладбищ, помогало заключенным в тюрьме и солдатам и т. д. Мусульманское общество имело целью «доставление средств к улучшению материального и нравственного состояния бедных мусульман Иркутска без различия пола, возраста, знаний и состояний».
Важным моментом в истории общины стало появление должности мухтасиба — главного муллы, отвечающего за соблюдение норм шариата и морали в различных сферах общественной жизни и быта. Резиденцией мухтасиба стал Иркутск, в его ведении находилось 45 магометанских приходов Иркутской, Енисейской губерний и Забайкальской области. Но должность просуществовала всего три года — с 1917 по 1920 год.
